RDS (objet R sérialisé) : fichier .rds

Le RDS sérialise un unique objet du langage R (un vecteur, une liste, un data frame, un modèle statistique ajusté) dans un fichier que la fonction readRDS() recharge ensuite en mémoire dans son état exact d’origine, sans passer par une ré-exécution du code qui l’a produit.

Par défaut, saveRDS() compresse le résultat en gzip, ce qui donne au fichier la signature binaire standard d’un flux gzip (1F 8B 08), identique à celle de n’importe quel fichier .gz. Cette compression peut être explicitement désactivée (compress = FALSE) pour accélérer l’écriture sur de très gros objets, au prix d’un fichier nettement plus volumineux et dépourvu de cette signature.

Le RDS ne doit pas être confondu avec le fichier de code source .R du même langage : l’un contient des instructions à exécuter, l’autre un objet déjà calculé et prêt à recharger tel quel. Cette distinction prête régulièrement à confusion chez qui découvre l’écosystème R, les deux extensions se ressemblant et appartenant au même langage sans rien partager de leur contenu.

Contrairement au fichier .RData, qui peut sauvegarder l’intégralité des objets présents dans une session de travail R en une seule fois, le RDS se limite volontairement à un seul objet par fichier, une contrainte qui en fait un choix plus prévisible pour partager ou archiver un résultat précis (un modèle entraîné, un jeu de données nettoyé) sans emporter tout l’environnement de travail qui l’a produit.

Cette sérialisation reste propre à la représentation interne des objets R : contrairement à des formats d’échange neutres comme JSON ou Parquet, un RDS n’est pas conçu pour l’interopérabilité entre langages différents, mais pour la persistance rapide et fidèle d’un objet R destiné à être rechargé par R lui-même.